26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6527 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 314 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  52.3 
 
 		 303 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  56.38 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  54.42 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  50.18 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  53.19 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  54.42 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  48.45 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  48.17 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  50.18 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  50.7 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  34.3 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  32.9 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  32.71 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  32.96 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  31.6 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  32.86 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  26.14 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  27.59 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  31.39 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  30.77 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  32.54 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  30.34 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  24.35 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>