34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3028 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  57.73 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  53.38 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  49.3 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  56.03 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  49.67 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  49.64 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  54.8 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  47.69 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  49.84 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  45.91 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  30.82 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  30.53 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  31.32 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  29.81 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  28.95 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  31.94 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  32.58 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  29.12 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  32 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  25.82 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  27.86 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  24.76 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  23.78 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3682  bacitracin transport permease  25 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  28.71 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  25 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3706  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  25.48 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.41 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3420  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease component  24.52 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1543  bacitracin transport permease protein bcrb  25 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3772  bacitracin transport permease protein bcrb  25 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3699  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>