41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1291 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 
293 aa  548  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  65.45 
 
 
301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  48.62 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  49.45 
 
 
293 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  45.52 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  42.81 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  49.3 
 
 
300 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  40.7 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  42.8 
 
 
245 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  41.35 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  32.88 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  32.58 
 
 
288 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  31.74 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  31.97 
 
 
314 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  41.06 
 
 
266 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  31.51 
 
 
296 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  32.72 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  39.57 
 
 
288 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  29.86 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  31.07 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  30.23 
 
 
299 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  29.08 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  30.87 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  27.61 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  27.86 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  24.33 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  34.18 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  42.05 
 
 
275 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  40.45 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  39.02 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  35.37 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  46.03 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.46 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2742  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  38.36 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  27.03 
 
 
391 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  40.26 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  40.26 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>