97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3358 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 301 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  71.43 
 
 		 307 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  43.58 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  43.52 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  36.93 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  35.53 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  33.2 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  28.45 
 
 		 359 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.92 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.99 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.32 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  25.64 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.05 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.48 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  27.37 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.26 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  20.9 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.69 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.48 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  23.12 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  31.52 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.27 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.12 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  25.91 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  29.73 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  23.4 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.84 
 
 		 483 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.27 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  27.6 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  24.62 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  27.89 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  37.38 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  26.51 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  29.23 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  29.23 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  31.02 
 
 		 480 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  24.68 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  35.58 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  23.77 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  39.62 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  25.47 
 
 		 465 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.62 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  22.68 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  26.37 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  30.71 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 623 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  25 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  26.97 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  23.08 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  27.62 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  26.55 
 
 		 964 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2612  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0496634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  22.16 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  23.37 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  21.14 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2059  hypothetical protein  32.73 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  32.14 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.38 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  27.27 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  26.27 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  32.86 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  32.86 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>