61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0457 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  100 
 
 
324 aa  621  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  85.27 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  60.75 
 
 
328 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  60.06 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  57.91 
 
 
318 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  58.82 
 
 
327 aa  342  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  45.43 
 
 
359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  39.94 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.96 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.76 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.27 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  27.54 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  35.68 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.38 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  27.32 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.91 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  26.56 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.36 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.31 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.89 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  38.93 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.58 
 
 
354 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  31.51 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.08 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  30.77 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  33.1 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  31.75 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  27.36 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  30.65 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  31.11 
 
 
271 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.82 
 
 
276 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.78 
 
 
276 aa  49.7  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.99 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  35.34 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  31.65 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  35.34 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.01 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.28 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  25.69 
 
 
272 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  33.57 
 
 
274 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  47.06 
 
 
271 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  32.82 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  28.68 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0815  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  28.47 
 
 
491 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  26.92 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.31 
 
 
483 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.01 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.88 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  30.46 
 
 
277 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  28.71 
 
 
275 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>