29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3360 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.17 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  30.79 
 
 		 479 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2048  hypothetical protein  33.79 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.598539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  33.64 
 
 		 470 aa  183  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  32.2 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  29.89 
 
 		 480 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5322  hypothetical protein  27.25 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4460  hypothetical protein  31.9 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267137  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.72 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  34.33 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  22.22 
 
 		 491 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  26.03 
 
 		 463 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.77 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 271 aa  46.6  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  40 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.17 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.4 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  30.07 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  46.94 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  29.89 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  42.86 
 
 		 274 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  52.5 
 
 		 278 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  52.5 
 
 		 278 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  52.5 
 
 		 278 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 319 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>