90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1332 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  100 
 
 
305 aa  596  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.2 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.67 
 
 
307 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  29.21 
 
 
294 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.13 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.63 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.17 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  26.47 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.45 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.05 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.67 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  28.71 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.5 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  36.89 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  35.16 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  28.14 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  28.42 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  33.15 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  34.33 
 
 
465 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.57 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.11 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.67 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  34.17 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.11 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.83 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  32.2 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
271 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.17 
 
 
276 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  36.13 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  28.22 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  28.74 
 
 
491 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.37 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  33.88 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  36.94 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  28.11 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  33.33 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  25.91 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  38.46 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.63 
 
 
273 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  38.74 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  36.04 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  36.04 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
283 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 
292 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
271 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  29.57 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.33 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  33.33 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  33.33 
 
 
276 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  29.78 
 
 
299 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  28.03 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  32 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  33.88 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  33.88 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  29.69 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  34.56 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  21.95 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  31.78 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  32.34 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  31.73 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  30.28 
 
 
480 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  33.64 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  46.34 
 
 
394 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  37.04 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  46.34 
 
 
394 aa  42.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>