33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3359 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  984    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  29.12 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  26.19 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  27.91 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04087  hypothetical protein  27.1 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5323  hypothetical protein  27.13 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4459  hypothetical protein  29.58 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448682  normal  0.0102439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01805  hypothetical protein  25.56 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3608  hypothetical protein  20.46 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.789533  decreased coverage  0.0000392195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  22.77 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01816  hypothetical protein  27.74 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000214666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  22.22 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  25.7 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  24.38 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  26.67 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  22.14 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  28.35 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.53 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  25.64 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  28.12 
 
 		 359 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.86 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  29.78 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  28.28 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.79 
 
 		 337 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.06 
 
 		 276 aa  47  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4460  hypothetical protein  25.52 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267137  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.17 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5322  hypothetical protein  19.78 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 		 278 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  47.62 
 
 		 278 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 		 278 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  47.62 
 
 		 278 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>