12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04087 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04087  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  837    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4459  hypothetical protein  50 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448682  normal  0.0102439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3608  hypothetical protein  40.1 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.789533  decreased coverage  0.0000392195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01805  hypothetical protein  38.28 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  34.47 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  32.5 
 
 		 463 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  26.97 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  27.83 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5323  hypothetical protein  26.52 
 
 		 482 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  32.93 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  25.09 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 623 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>