17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4459 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4459  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  882    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448682  normal  0.0102439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04087  hypothetical protein  50 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3608  hypothetical protein  40.15 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.789533  decreased coverage  0.0000392195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  35.04 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01805  hypothetical protein  34.63 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  31.11 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  27.51 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5323  hypothetical protein  28.22 
 
 		 482 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  29.52 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  24.2 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  24.28 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  31.11 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  23.75 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01816  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000214666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  31.01 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>