46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3332 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  100 
 
 		 483 aa  985    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  40.04 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  32.38 
 
 		 475 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4460  hypothetical protein  33.57 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267137  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  29.73 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.13 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.65 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  30.02 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5322  hypothetical protein  29.45 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2048  hypothetical protein  25.57 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.598539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  27.61 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  24.15 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.84 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.26 
 
 		 307 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  28.67 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.71 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  20.88 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.13 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  28.93 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  28.68 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  23.32 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  23.55 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.03 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.22 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  22.15 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  24.82 
 
 		 286 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  28.99 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  27.12 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  31.58 
 
 		 269 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  35.06 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  27.13 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  40.68 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  44 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  42.31 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.23 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.12 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  23.14 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.21 
 
 		 367 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 283 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 242 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.8 
 
 		 400 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 322 aa  43.5  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  29.03 
 
 		 265 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>