101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1643 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  100 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  47.54 
 
 
298 aa  235  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  44.15 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 
276 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  35 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  33.67 
 
 
278 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
322 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 
277 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
283 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  33.9 
 
 
279 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  33.22 
 
 
278 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 
273 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  30.85 
 
 
269 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  28.91 
 
 
265 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  31.16 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.45 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  29.22 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  33.51 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.25 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  33.51 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.35 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  32.98 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  31.53 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  30.26 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  28.33 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  27.52 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  27.88 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  27.62 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.89 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  31.71 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  34.23 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  28.91 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  34.23 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  34.87 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
623 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.49 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.95 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.38 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
272 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  32.37 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  26.87 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  27.1 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  27.1 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.73 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  28.99 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  28.7 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  30.1 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  30.77 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  27.64 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  27.87 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.61 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  30.29 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  32.02 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  23.39 
 
 
270 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.18 
 
 
301 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  33.33 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  27.31 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  27.51 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.84 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  29.17 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 
281 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.44 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  26.05 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  28.65 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.77 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  26.76 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  27.16 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.71 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  26.88 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.95 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.56 
 
 
483 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.74 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>