84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0229 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 
269 aa  527  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  33.46 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  38.21 
 
 
274 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 
283 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  33.22 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
319 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  33 
 
 
298 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 
290 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  33.11 
 
 
299 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  31.77 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  32.58 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  34.19 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  31.45 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  29.14 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
278 aa  82  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  29.74 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.32 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  31.06 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.37 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  29.96 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  33.13 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  33.13 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  29.79 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  32.1 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  29.86 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.15 
 
 
276 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  29.48 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  29.48 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  23.36 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  30.28 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 
307 aa  58.9  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.14 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  27.24 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  27.01 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  39.09 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  31.48 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  34.91 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  36.61 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  30.07 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  25.97 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  28.24 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.62 
 
 
301 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  28.41 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  33.64 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  26.19 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  29.81 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.83 
 
 
483 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  29.84 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  26.62 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  26.6 
 
 
269 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  27.84 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  32.28 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  30.11 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  30.68 
 
 
275 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 
292 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  32.92 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  25.65 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  31 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.53 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  27.63 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.61 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  29.15 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.56 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  28.78 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>