98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0431 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  100 
 
 		 275 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  92.73 
 
 		 275 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  72 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  69.93 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  69.06 
 
 		 276 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  63.41 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  64.13 
 
 		 276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  64.13 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  44.4 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  45.55 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  43.73 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  43.01 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  41.16 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  44.2 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  37.68 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  49.59 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  50 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  41.18 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  43.22 
 
 		 271 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  48.11 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  41.03 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  40.58 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  43.22 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  41.79 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  41.76 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  41.76 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  41.76 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  41.76 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  44.19 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  41.76 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  41.18 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  41.18 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  37.26 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  32.61 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  25.19 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.3 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  28.73 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  33.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.16 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.37 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  29.76 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.57 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.35 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  28.62 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  36.75 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  30.68 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  31.25 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  27.22 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.1 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  25.44 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  34.17 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.56 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  23.22 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  23.53 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3410  hypothetical protein  34.62 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153814  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  30.83 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  23.39 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  24.24 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  24.76 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.91 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  46.67 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  28.07 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  31.06 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 380 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 380 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  42.31 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  30.26 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  34.65 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>