115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3197 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  100 
 
 		 274 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  70.44 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  73.72 
 
 		 274 aa  311  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  46.57 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  46.34 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.31 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  44.13 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.31 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  43.32 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  43.82 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  43.27 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  41.74 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  40.16 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  46.58 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  43.81 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  46.02 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  40.35 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  37.77 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  44.16 
 
 		 274 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  40.53 
 
 		 272 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  46.46 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  46.46 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  38.83 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  40.43 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  40.43 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  45.45 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  45.04 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  42.26 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  42.26 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  42.26 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  42.26 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  40.31 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  33.89 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  43.75 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  42.97 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  36.44 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.01 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  30 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  32.7 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  42.48 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  26.22 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  36.09 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  25 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  24.11 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  27.11 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.85 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.88 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  38.84 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  34.17 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  30.27 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.37 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  25.89 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  24.24 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  43.55 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.07 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.63 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.15 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.33 
 
 		 328 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  33.9 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.09 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  31.25 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  24.41 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  35.71 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  34.91 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  38.89 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 405 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  41.54 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  41.54 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  31.97 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  27.61 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 768 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  30.66 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>