37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1572 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  35.09 
 
 
263 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  37.11 
 
 
257 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  37.11 
 
 
257 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  33.2 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  33.07 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  33.08 
 
 
253 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  33.46 
 
 
253 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  32.41 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  29.3 
 
 
257 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  31 
 
 
270 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  30.19 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  29.46 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  25.68 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  25.77 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  27.41 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  27.65 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  28.76 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  27.1 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  27.36 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  25.25 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1992  hypothetical protein  23.65 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.141259  normal  0.0904495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.65 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  28.47 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3410  hypothetical protein  32.11 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153814  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  33.33 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  42.59 
 
 
363 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  48.65 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  27.67 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  34.88 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  28.04 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  41.07 
 
 
333 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>