29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3764 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  93.45 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  40.65 
 
 
280 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  37.05 
 
 
277 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  38.46 
 
 
292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  35.64 
 
 
289 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  33.11 
 
 
290 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2247  ABC transporter permease  33.68 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  29.76 
 
 
286 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1484  hypothetical protein  34.04 
 
 
285 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3410  hypothetical protein  32.16 
 
 
301 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153814  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  28 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  24.58 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  28.99 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  28.68 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  29.36 
 
 
330 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  37.88 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  24.19 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  39.71 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  25.53 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  46.15 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>