22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1484 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1484  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3410  hypothetical protein  73.05 
 
 
301 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153814  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  34.49 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  34.02 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  35.79 
 
 
275 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  25.7 
 
 
280 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  34.04 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  28.03 
 
 
277 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.82 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2247  ABC transporter permease  29.25 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  22.7 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  26.49 
 
 
263 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  27.72 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  26.29 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 
259 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  25.23 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  29.47 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  31.62 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  28.7 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  34.4 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  28.69 
 
 
257 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>