27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3279 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  93.45 
 
 		 276 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  38.49 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  35.97 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  37.07 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  38.28 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2247  ABC transporter permease  31.93 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  29.76 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1484  hypothetical protein  34.4 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3410  hypothetical protein  33.57 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153814  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  28.47 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  29.91 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  29.36 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  37.88 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  21.38 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  25.64 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>