18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0058 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  27.34 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  27.34 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  22.84 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  21.35 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  25.66 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  27.04 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  23.97 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  25.91 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  25.32 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  26.23 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  24.36 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  25.32 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  23.14 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  27.86 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>