34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2674 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  61.11 
 
 
270 aa  315  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  29.52 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  30.57 
 
 
257 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  29.81 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  33.47 
 
 
257 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  31.28 
 
 
271 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  26.01 
 
 
257 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  30.45 
 
 
257 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  30.45 
 
 
257 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  28.96 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  29.66 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  27.51 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  29.55 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  29.56 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  30.94 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  31.25 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  27.31 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  26.42 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1992  hypothetical protein  23.55 
 
 
308 aa  55.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.141259  normal  0.0904495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  24.82 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  26.03 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  27.59 
 
 
276 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0586  ABC transporter permease  33.96 
 
 
597 aa  44.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.392661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  28.44 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  27.48 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  27.48 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.71 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  34.43 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  29.5 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  27.5 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>