23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1638 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  71.59 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  75.76 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  63.64 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  51.14 
 
 		 263 aa  268  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  47.24 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  35.11 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  30.94 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  28.03 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  26.62 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  27.66 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  27.66 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  25.31 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  25.89 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  25.54 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  24.54 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  25.97 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  25.97 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  21.88 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.69 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1484  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>