27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5300 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  100 
 
 
257 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  68.09 
 
 
257 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  68.09 
 
 
257 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  56.42 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  51.36 
 
 
257 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  50.58 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  50.97 
 
 
257 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  33.07 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  32.82 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  30.11 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  31.13 
 
 
253 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  31.8 
 
 
252 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  29.55 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  28.08 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  25.66 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  24.71 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  24.9 
 
 
271 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  30.14 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  22.26 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  24.51 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  25.9 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  22.53 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  22.75 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  26.58 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  25.45 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.33 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1132  hypothetical protein  32.09 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>