21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1499 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  53.76 
 
 
263 aa  264  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  50.38 
 
 
264 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  51.52 
 
 
264 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  51.14 
 
 
264 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  50.59 
 
 
271 aa  228  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  29.81 
 
 
270 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  29.1 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  27.73 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  27.27 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  28.62 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  28.62 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  25.68 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  26.74 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  29.86 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  24.9 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  24.34 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  22.87 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  25.27 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>