101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3324 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  100 
 
 		 273 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  70.44 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  73.99 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  46.4 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  45.26 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  43.96 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  45.19 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  47.01 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  44.16 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  45.08 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  41.74 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.86 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.86 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  40.43 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  41.39 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  38.85 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  46.33 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  41.13 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  48.18 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  48.18 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  41.39 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  41 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  44.74 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  44.74 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  43.1 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  42.62 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  42.62 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  41.33 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  41.33 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  41.67 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 295 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  35.97 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  38.43 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  32.14 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  41.67 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  40.98 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.1 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  24.59 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.59 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  36.43 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  20.56 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  34.11 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  40.18 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.31 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  26.27 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  25.96 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  33.33 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  50 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  26.61 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.25 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  32.63 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.83 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.49 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  37.08 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  30.33 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  37.33 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.84 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.73 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  38.46 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  33.79 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.12 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  24.56 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  42.59 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  33.75 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2612  hypothetical protein  33.75 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0496634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  27.47 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  30.07 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 380 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  30.95 
 
 		 257 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>