40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0452 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  100 
 
 
255 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  33.86 
 
 
255 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  22.46 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  24.48 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  22.65 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  22.46 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  21.32 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  20.69 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  23.81 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  23.58 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  23.5 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  20.35 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  25.23 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  25.23 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  19.73 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  24.46 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  24.27 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  21.08 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  22.97 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  23.79 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  20.63 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  20.63 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  20.63 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  22.96 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  23.56 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  24.31 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  21.83 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  20.18 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  28.44 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  20.18 
 
 
280 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  20.69 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  24.32 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  20.95 
 
 
280 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>