107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3403 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 272 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  77.57 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  70.59 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  70.59 
 
 		 272 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  52.9 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  51.27 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  50.18 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  55.6 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  55.19 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  47.84 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  43.68 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  43.12 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  42.03 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  41.61 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  40.67 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  43.82 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  44.04 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  39.18 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  43.45 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  43.45 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  41.29 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  44.15 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  44.19 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  44.27 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  42.91 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  42.91 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  42.6 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.96 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  41.97 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  43.49 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  43.49 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.96 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  44.44 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  45.13 
 
 		 274 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  42.6 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  44.2 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  45.42 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  43.01 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  44.28 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  42.04 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  32.25 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.38 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  25.86 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  32.71 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.64 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.11 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.56 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  25 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  25.93 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  37.69 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  36.92 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  21.98 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  30.85 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  23.58 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  27.56 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  29.78 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  22.71 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  29.04 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  22.83 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  35.85 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.97 
 
 		 328 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  31.03 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.78 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  24.24 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  22.46 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.73 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  27.67 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.66 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  28.32 
 
 		 359 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  26.71 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.77 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  30.77 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.81 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.24 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>