162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1056 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  100 
 
 
271 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  100 
 
 
271 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  75.93 
 
 
271 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  74.07 
 
 
275 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  70.74 
 
 
273 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  76.67 
 
 
271 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  71.85 
 
 
274 aa  341  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  79.34 
 
 
271 aa  338  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  72.96 
 
 
274 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  72.96 
 
 
274 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  62.17 
 
 
278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  61.8 
 
 
278 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  61.8 
 
 
278 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  61.8 
 
 
278 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  62.03 
 
 
278 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  50.19 
 
 
276 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  45.22 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  47.62 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  43.49 
 
 
272 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  40.15 
 
 
272 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  38.75 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  41.18 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 
272 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  46.67 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  37.45 
 
 
275 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  38.01 
 
 
275 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  51.57 
 
 
275 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  42.38 
 
 
276 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  51.12 
 
 
275 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  40.52 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  40.6 
 
 
276 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  45.75 
 
 
273 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  43.36 
 
 
276 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  43.36 
 
 
276 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
292 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  41.44 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  36.67 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
276 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
279 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
295 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
295 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 
295 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
279 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
286 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
282 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 
319 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
283 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.77 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.33 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  30.24 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  30.63 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  28.85 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  39.86 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.71 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  30.71 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.68 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  26.41 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.06 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  29.76 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  25.22 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  40.52 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.27 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  27.51 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.1 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  25 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  30.04 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  30.17 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  29.21 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  26.75 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.38 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.62 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  28.86 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.17 
 
 
337 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.79 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  32.31 
 
 
321 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  25.45 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  35.38 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  32.64 
 
 
359 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.27 
 
 
363 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.47 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  25.85 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>