26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1043 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  37.24 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0420  ABC-2 type transporter  49.12 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0643104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.85 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.85 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  30.85 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  36.54 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  34.81 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  34.31 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  34.26 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  31.79 
 
 		 760 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  30.53 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  33.64 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.11 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  31.82 
 
 		 378 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  34.81 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  34.81 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>