11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0420 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0420  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 262 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0643104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  83.21 
 
 		 262 aa  417  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  30.41 
 
 		 760 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  31.1 
 
 		 483 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  32.2 
 
 		 482 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  43.86 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1747  ABC-2 type transport system permease protein  26.24 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1321  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 365 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.800168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>