11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3117 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  100 
 
 
760 aa  1490    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.48 
 
 
754 aa  347  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  41.6 
 
 
482 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  41.4 
 
 
483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  38.16 
 
 
243 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
257 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 
273 aa  44.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  34.48 
 
 
274 aa  44.3  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  26.87 
 
 
392 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 
274 aa  44.3  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.25 
 
 
197 aa  43.9  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>