29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1789 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  100 
 
 
754 aa  1450    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  36.63 
 
 
760 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  40.62 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  41.75 
 
 
483 aa  297  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  36.23 
 
 
215 aa  64.3  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  31.01 
 
 
193 aa  59.7  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  28.17 
 
 
321 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.57 
 
 
188 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 
243 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
197 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 
390 aa  53.9  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  34.83 
 
 
246 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  38.55 
 
 
337 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  27.8 
 
 
328 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  31.82 
 
 
189 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  26.85 
 
 
197 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  36.9 
 
 
396 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  26.05 
 
 
331 aa  47.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.59 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1469  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
254 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 
257 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  46 
 
 
415 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
286 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  46.81 
 
 
387 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 
271 aa  45.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
281 aa  45.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.21 
 
 
271 aa  44.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  35.23 
 
 
331 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>