46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0946 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  100 
 
 
188 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  46.82 
 
 
197 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2043  hypothetical protein  52.13 
 
 
188 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  42.33 
 
 
189 aa  154  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  34.41 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  37.93 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.2 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  31.72 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1813  hypothetical protein  29.55 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.6 
 
 
379 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  34.29 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.26 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  38.14 
 
 
329 aa  61.6  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1074  hypothetical protein  28.41 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0843  hypothetical protein  28 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100965  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  28.25 
 
 
321 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.55 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.57 
 
 
754 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  27.72 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  32 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  45.45 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.05 
 
 
335 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2615  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.23 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0706719  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1023  hypothetical protein  33.7 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0908  hypothetical protein  27.37 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.35 
 
 
511 aa  48.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  24.17 
 
 
324 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  24.87 
 
 
322 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.95 
 
 
331 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1213  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00201716  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0203  hypothetical protein  23.89 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.73 
 
 
320 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.85 
 
 
509 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  27.1 
 
 
325 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  29.1 
 
 
331 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.57 
 
 
315 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  29.77 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0796  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.28 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.569051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.33 
 
 
528 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  25.79 
 
 
337 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  28.46 
 
 
603 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  27.54 
 
 
331 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_996  hypothetical protein  29.83 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0032  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.23 
 
 
318 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3073  stage II sporulation protein M related  30.43 
 
 
117 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00355669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>