45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2043 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2043  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  353  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  52.13 
 
 
188 aa  198  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  50.87 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  44.68 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  35.26 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  38.51 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.92 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.59 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  37.8 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.54 
 
 
528 aa  65.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.15 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  38.89 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  34.81 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  33.59 
 
 
321 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  36.8 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
335 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36 
 
 
509 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.09 
 
 
342 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  28.26 
 
 
603 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.6 
 
 
511 aa  51.2  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1023  hypothetical protein  28.72 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  30.41 
 
 
322 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.03 
 
 
331 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.17 
 
 
754 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.62 
 
 
318 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  34.45 
 
 
356 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  34.18 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0843  hypothetical protein  31.25 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100965  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  35.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0828  hypothetical protein  31.51 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.56 
 
 
320 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1213  hypothetical protein  32.71 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00201716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.49 
 
 
331 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  29.03 
 
 
337 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2615  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.65 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0706719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  34.75 
 
 
335 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0203  hypothetical protein  23.84 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1095  hypothetical protein  28.17 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1813  hypothetical protein  27.69 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.97 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.58 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_996  hypothetical protein  30.91 
 
 
185 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0032  hypothetical protein  23.73 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  26.09 
 
 
336 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>