19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1813 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1813  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1074  hypothetical protein  91.84 
 
 
196 aa  358  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0843  hypothetical protein  92.82 
 
 
196 aa  358  3e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100965  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0908  hypothetical protein  65.64 
 
 
196 aa  251  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.55 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.82 
 
 
318 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  27.12 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  40.85 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  31.67 
 
 
324 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.68 
 
 
509 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  32.69 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.77 
 
 
315 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.87 
 
 
329 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.52 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.17 
 
 
528 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.05 
 
 
327 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  41.2  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>