57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4440 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  100 
 
 		 325 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  69.63 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  67.48 
 
 		 326 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  66.77 
 
 		 328 aa  411  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  64.02 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  65.23 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  63.41 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  46.76 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  47.56 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.24 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  35.37 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  33.94 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  29.07 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.59 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.72 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  31.95 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  25.08 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  28.14 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.15 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  27.38 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.52 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  26.87 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  29.67 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.89 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  25.44 
 
 		 603 aa  89  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  25.51 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  24.06 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.17 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  27.62 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.38 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  28.09 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  28.09 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  28.09 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  25.85 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.55 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.47 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  26.99 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.33 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  24.38 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  23.68 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  26.01 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  23.43 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  24.83 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.96 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.91 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.7 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.03 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.85 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  25.34 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.58 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.44 
 
 		 211 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  25.86 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.03 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.1 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.13 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.78 
 
 		 509 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 172 aa  42.4  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>