62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  71.17 
 
 
326 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  69.02 
 
 
326 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  68.1 
 
 
326 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  68.71 
 
 
326 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  65.23 
 
 
325 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  67.68 
 
 
328 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  49.55 
 
 
342 aa  310  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.39 
 
 
330 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.31 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  34.74 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  34.63 
 
 
335 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  29.45 
 
 
336 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.94 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.01 
 
 
331 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  30.33 
 
 
336 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  29.21 
 
 
321 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.09 
 
 
331 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  24.46 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  31.86 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  28.79 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.55 
 
 
315 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.97 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  29 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.6 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  25.31 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  25.08 
 
 
603 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  26.79 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  26.79 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  26.79 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  28.15 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  24.5 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.38 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.75 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  28.18 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  23.84 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.19 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.27 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.21 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  21.38 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.62 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  23.95 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  21.85 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  23.76 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.75 
 
 
211 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  28.96 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.76 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  29.05 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.46 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  21.32 
 
 
327 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  24.77 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  27.97 
 
 
181 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.27 
 
 
528 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  26.57 
 
 
175 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.1 
 
 
191 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
509 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.09 
 
 
754 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  29.81 
 
 
197 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>