56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1334 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  88.48 
 
 
330 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  77.88 
 
 
330 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  77.88 
 
 
330 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  77.88 
 
 
330 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  68.79 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  66.26 
 
 
331 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  55.66 
 
 
331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  55.02 
 
 
331 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  51.85 
 
 
336 aa  332  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  50.15 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  56.02 
 
 
334 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  52.01 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.54 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  50.45 
 
 
332 aa  301  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  50 
 
 
329 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.85 
 
 
329 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  52.02 
 
 
329 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  49.38 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  46.58 
 
 
328 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  47.16 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  45.2 
 
 
328 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  45.96 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  44.89 
 
 
331 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  30.59 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.89 
 
 
320 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  29.25 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.9 
 
 
331 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.84 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.27 
 
 
342 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  23.15 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  26.87 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  24.46 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  28.8 
 
 
347 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  26.09 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  30.53 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  26.42 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  23.29 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  24.48 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  24.46 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.27 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.81 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  21.59 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  21.91 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.34 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  23.84 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  23.93 
 
 
603 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  28.19 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  23.23 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  21.84 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  22.96 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.36 
 
 
211 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  33.33 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
509 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  28.25 
 
 
193 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.27 
 
 
754 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>