91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0488 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  89.32 
 
 		 286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  79.93 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  57.45 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  60.73 
 
 		 276 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  60.36 
 
 		 282 aa  271  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  51.81 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  52.1 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  43.38 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  52.4 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  52.77 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  52.21 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  40.47 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  52.42 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  51.3 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  41.61 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  52.4 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  40.88 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  38.91 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  39.93 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  41.15 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  37.19 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  40.89 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  35.16 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  34.32 
 
 		 275 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  35.8 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  42.17 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  42.17 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  37.72 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  38.1 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  38.1 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  35.65 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  35.65 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  34.88 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  37.24 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  36.68 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  39.3 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  39.3 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  33.96 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  34.96 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  34.07 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  33.33 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  27.54 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  28.63 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  28.9 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  30.58 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  31.67 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  31.53 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  26.84 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.66 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  28.32 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  28.51 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  24.45 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  23.67 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  26.85 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  29.59 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  27.64 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  27.86 
 
 		 305 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.57 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.62 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.77 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  22.95 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  23.11 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  23.74 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.92 
 
 		 367 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  26.18 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.31 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.4 
 
 		 754 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  25.61 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  25.52 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.09 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>