98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4216 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  100 
 
 		 274 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  73.72 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  73.99 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  44.69 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  45.42 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  44.73 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  43.43 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  42.91 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  42.68 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.96 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  44.54 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  44.11 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  39.93 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  38.78 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  39.42 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  40.66 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  40.67 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  39.91 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  38.82 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  39.49 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  41.56 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  41.56 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  41.85 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  47.68 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  47.68 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  38.83 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  38.83 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  37.1 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  42.15 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  42.15 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  41.4 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  32 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  35.56 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  33.5 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  21.4 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  39.17 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.39 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  34.81 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.33 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.79 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.67 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  23.5 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.31 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  38.18 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.53 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.41 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  44.64 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  26.85 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  30.09 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.94 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.1 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  28.95 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.78 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  35.25 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  20.16 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  31.78 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  47.5 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  39.06 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  38.46 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  51.02 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  29.77 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  25.47 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  32.11 
 
 		 269 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  41.54 
 
 		 380 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  45 
 
 		 293 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 330 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>