99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3868 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  93.47 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  74.66 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  73.02 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  70.86 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  67.8 
 
 		 295 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  66.78 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  52.57 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  52.4 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  47.23 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  50.92 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  44.19 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  42.6 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  42.7 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  39.85 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  40 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  38.43 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  38.79 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  39.65 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  35.94 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  39.21 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  36.52 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  41.82 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  37.02 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  40.35 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  40.35 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  39.77 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  38.89 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  38.89 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  36.11 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  34.38 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 		 278 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  36.11 
 
 		 278 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  44.05 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  38.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  44.3 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  33.46 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  35.75 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  36.62 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  33.19 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  31.56 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.43 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.9 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  28.74 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  27.07 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  31.35 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  31.55 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.79 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  28.97 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.42 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  25.71 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  31.71 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  33.06 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.38 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  32.23 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  36.89 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.36 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  32.03 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  30.7 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  26.2 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  24.11 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  23.4 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.51 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  25.45 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  33.66 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  35.71 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  30.48 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  39.68 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  33.05 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  26.19 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.67 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  31.06 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 		 623 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  29.76 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>