33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0788 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  530  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  29.56 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  28.81 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  26.95 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  26.74 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  28.17 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  30.27 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  36.36 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.97 
 
 
301 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  26.09 
 
 
272 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 
623 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  35.54 
 
 
337 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  27.11 
 
 
280 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  26.86 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  26.46 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.58 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  34.71 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  27.17 
 
 
273 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  34.94 
 
 
275 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>