112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3643 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  100 
 
 
322 aa  632  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  57.69 
 
 
319 aa  346  3e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 
276 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 
283 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  31.76 
 
 
299 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 
273 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  32.01 
 
 
277 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.34 
 
 
298 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  32.11 
 
 
265 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
290 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  31.17 
 
 
278 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  32.67 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 
274 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  32.55 
 
 
269 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  30.13 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  30 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  29.87 
 
 
280 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  33.68 
 
 
272 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.97 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.85 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.85 
 
 
278 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  25.74 
 
 
283 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 
278 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
623 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.85 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  35.23 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  27.94 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  32.12 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  30.32 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  36.81 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  34.54 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  36.81 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  34.54 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  27.73 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  29.92 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  34.13 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.35 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  35.61 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  23.75 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  30.46 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  35.2 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  40 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.79 
 
 
276 aa  63.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  29.53 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  30.61 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  24.89 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.13 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  28.99 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  29.55 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  33.33 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  32.46 
 
 
275 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  30.05 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.1 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.95 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  28.19 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.51 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  28 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.97 
 
 
354 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  34.62 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  38.89 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  27 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  38.1 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  29.05 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  29.66 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.1 
 
 
276 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
281 aa  52.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  30.71 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.56 
 
 
483 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.3 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.95 
 
 
254 aa  50.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
352 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  26.07 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.47 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
291 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  33.85 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.84 
 
 
275 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>