35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2163 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  29.71 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  26.79 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  30.41 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  31.82 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  37.24 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  28.96 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.82 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  27.98 
 
 
275 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.82 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
273 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  30 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  30 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
278 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  28.5 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  29.58 
 
 
278 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  28.68 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  27.59 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  51.06 
 
 
480 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.27 
 
 
278 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  43.86 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.2 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  25.35 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.95 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 
369 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  26.13 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>