86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0491 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 279 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  79.93 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  79.78 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  65.22 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  62.41 
 
 		 274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  65.23 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  50.95 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  56.15 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  43.8 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  52.57 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  43.8 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  50.92 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  50.74 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  39.34 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  51.62 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  41.09 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  39.63 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  38.13 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  42.28 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  41.59 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  37.96 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  38.97 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  36.63 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  37.73 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  41.25 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  36.26 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  41.25 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  36.26 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  40.83 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  40.83 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  39 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  39 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  36.82 
 
 		 274 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  33.08 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  33.08 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  35.26 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  34.93 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  33.65 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  34.96 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  32.89 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  24.91 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.48 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  28.23 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  31.3 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  30.53 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  30.26 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  26.59 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  36.04 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  29.96 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  27.03 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  32.16 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  30.04 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  26.13 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  30.61 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  26.01 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  26.2 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  26.15 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.28 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  25.29 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.48 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.44 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  24.19 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  35.19 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.01 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.66 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  26.45 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>