49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0725 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  100 
 
 		 328 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  86.89 
 
 		 327 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  81.4 
 
 		 328 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  57.91 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  62.15 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  60.06 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  44.61 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  41.03 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  38.59 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.84 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.45 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  33.05 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  24.68 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  26.77 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.35 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.03 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.2 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.48 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  36.43 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.64 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  24.1 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  37.19 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  28.86 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  23.49 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  23.51 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  29.01 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  33.33 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.97 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  29.84 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  31.97 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.58 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.93 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  27.78 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.58 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  31.09 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  27.69 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  32.31 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  32.31 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  27.42 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  26.12 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  27.32 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  30.32 
 
 		 465 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 272 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>