26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2968 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  100 
 
 		 274 aa  508  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2679  copper ABC transporter permease  48.62 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0349  hypothetical protein  42.16 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.192947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1724  copper ABC transporter permease  38.97 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.91 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  34.78 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  25.96 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  28.99 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  26.96 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  31.35 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.04 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  27.22 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.43 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  28.78 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  25.93 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.11 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.35 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  28.03 
 
 		 298 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  23.86 
 
 		 278 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 271 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 		 278 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>