43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2679 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2679  copper ABC transporter permease  100 
 
 
300 aa  568  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  48.62 
 
 
274 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1724  copper ABC transporter permease  42.34 
 
 
287 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0349  hypothetical protein  44.91 
 
 
276 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.192947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.2 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.51 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  26.84 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  23.93 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  28.07 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  30.97 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  28.57 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  26.5 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  26.5 
 
 
278 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 
278 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  29.31 
 
 
294 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  21.94 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.56 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  30.33 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  26.46 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.1 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  27.14 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
271 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  32.38 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.32 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  22.04 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  27.24 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  32.54 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  29.65 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  27.24 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  30.95 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.88 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  32.77 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  33.33 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  29.02 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
278 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>