26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3231 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  35.31 
 
 
363 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  37.5 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  35.47 
 
 
309 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  39.46 
 
 
301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  34.5 
 
 
283 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  30.77 
 
 
334 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 
289 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  28.64 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  28.57 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  31.37 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  29.32 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.71 
 
 
301 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.6 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.76 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  27.12 
 
 
373 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  28.95 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  29.71 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  28.85 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  28.85 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>