45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3300 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 270 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  46.24 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  44.44 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  42.8 
 
 		 286 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  44.74 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  42.48 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  39.08 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  42.27 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  42.98 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  38.46 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  33.09 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  32.09 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  32.08 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  34.89 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  34.7 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  35.66 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  37.04 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  28.03 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  38.02 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  36.47 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  34.07 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  32.6 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  32.09 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  32.1 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  28.68 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  29.44 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  27.92 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 330 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  32.29 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  27.91 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  30.69 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  30.69 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  30.69 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  33.33 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  31.07 
 
 		 457 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  32.05 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  31.69 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1812  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.9 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1518  putative ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>